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Gaussian个人学习 #1 (结构优化、结合能计算、结合能分解、静电势)

2026/9/5 15:42:04 拓冰建站 浏览量
Gaussian个人学习 #1 (结构优化、结合能计算、结合能分解、静电势) 20240703结构优化在优化中出现l9999错误,可能结构在优化过程中出现了震荡,无法达到收敛限,可以尝试一下方法:从实用性出发,对于大多数情况,对于初学者笔者推荐按照以下顺序去尝试解决震荡问题:1 对于DFT,特别是明尼苏达系列泛函(如M062X、M06、M06L),首先加上int=ultrafine再试(从G16开始此为默认,不再需要尝试此项)。如果用了SMD,改用IEFPCM2 如果体系小,尝试opt=calcall。如果体系大算得慢,此关键词会令计算量进一步激增,实在没辙再考虑这个,或者尝试opt=recalc=3或53 尝试opt=gdiis4 尝试opt(gdiis,maxstep=x,notrust),x为3~55 如果上述做法都不灵,干脆改成loose收敛限,但如果之后做振动分析容易有虚频http://sobereva.com/164如改为:# opt=gdiis b3lyp/3-21+g* scrf=(iefpcm,solvent=water) em=gd3bj采用em=gd3bj加色散校正。可以将失败的log文件导入gaussianview,勾选read intermediate geometries(optimizations),可以在右键中看能量,力的波动情况,并观看结构随优化的变化。结合能计算对于复合物,通常在相同级别下分别优化复合物以及各个单体,再在相同级别下计算这几个部分的单点能,然后将复合物的单点能减去各个单体的单点能即可。将一个分子复制到其他文件中,通过移动单体的位置(alt+鼠标中键、al